Колонофлор-16 (исследование состава микробиоты толстого кишечника, ПЦР real time)

Подготовка к исследованию:

• Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов, либо не ранее, чем через 14 дней после проведенной антибактериальной терапии.
• Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить (по согласованию с врачом) прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.), и препаратов, влияющих на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Повышение значений (положительный результат):

• Данный анализ включает в себя множество показателей, оценку отклонений производит лечащий врач.

Микробиота кишечника человека представляет собой сложную, динамичную экосистему, населенную множеством микроорганизмов, включая бактерии, грибы, археи и вирусы. Они взаимодействуют между собой и с организмом человека, участвуя во множестве метаболических процессов. Общее количество микробных клеток в кишечнике человека может на порядок превышать число собственных клеток организма. Совокупное число белок-кодирующих генов микробиоты в сотни раз больше количества человеческих генов. Это позволяет кишечному микробиому выполнять ряд функций, которые недоступны клеткам организма человека.

Микробиота кишечника участвует в метаболизме углеводов и белков, обмене жиров, а также производит такие важные промежуточные продукты обмена веществ, как короткоцепочечные жирные кислоты (КЖК), вторичные желчные кислоты (ВЖК), витамины и липополисахариды. Эти метаболиты выполняют роль сигнальных молекул, участвующих в работе всех систем организма человека, в том числе влияют на аппетит, перистальтику кишечника, потребление и накопление энергии. Микробиота стимулирует созревание иммунной системы и участвует в обеспечении барьерной функции кишечника, защищая его от колонизации патогенами.

Состав микробиоты кишечника – совокупность микроорганизмов, населяющих его, в том числе это облигатные представители микрофлоры толстого кишечника (бифидобактерии, лактобациллы, кишечная палочка), а также условно-патогенные и патогенные микроорганизмы. Облигатную микрофлору составляют ана­эро­бы: бифидобактерии, пропионобактерии, пепто­стреп­тококки и аэробы (лактобактерии, энтерококки и эше­ри­хии). Факультативная микрофлора представлена са­профитами (бактериоиды, пептококки, стафилококки, стрептококки, бациллы, дрожжевые грибы) и аэробными и анаэробными бациллами. К условно-патогенным энтеробактериям относятся кишечные бактерии: клебсиеллы, протеи, цитро­бак­теры, энтеробактеры.

На видовом уровне сложно выделить филогенетическое "ядро микробиоты" – доминирующие микроорганизмы, встречающиеся у большинства людей (>50%). Это связано с функциональной избыточностью микробиоты: ряд функций может выполняться представителями разных таксонов. Кроме того, метаболические функции микроорганизмов могут быть гомогенны даже внутри семейства, то есть разные виды могут функционально замещать друг друга и преобладать в микробиоте разных здоровых людей без нарушения биоценоза.

Стандартным методом исследования состава микробиоты человека является культуральный метод. Однако 50-80% микроорганизмов, составляющих кишечную микробиоту, являются труднокультивируемыми и не выявляются микробиологическим методом, кроме того, результаты посева напрямую зависят от сохранения жизнеспособности микроорганизмов. Посев кала на дисбактериоз предполагает выявление определенного спектра бактерий и грибов в отличие от стандартного посева, при котором происходит культивирование широкого перечня микроорганизмов на различных питательных средах. В то же время исследование на дисбактериоз имеет ограничения, свойственные микробиологическому анализу в целом.

В настоящее время наиболее оптимальный подход для исследования микробиоты – применение технологии ПЦР в реальном времени. Это точное и быстрое количественное определение микроорганизмов в образце с использованием видоспецифичных или группоспецифичных праймеров и последующей нормализацией полученных результатов на количество копий генов-мишеней. Многопробирочный и мультиплексный формат исследования позволяет сочетать выявление крупных таксонов с детекцией нескольких ключевых видов и/или субпопуляций микробиоты.

Когда назначается исследование:

• При необходимости определения качественного состава и количественной оценки микробиоты толстого кишечника в ходе проведения лечебно-диагностических мероприятий.
• Длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы.
• Дисфункция кишечника при интенсивной антибиотико- и/или иммуносупрессивной терапии, длительной химиотерапии, гормональной терапии.
• Затянувшийся период восстановления после дизентерии и других острых кишечных инфекционных заболеваний.
• Предоперационный период у лиц с факторами риска развития дисбактериоза кишечника.
• Аллергические заболевания (атопический дерматит, бронхиальная астма и пр.), трудно поддающиеся лечению.
• Иммунодефицитные состояния.
• Частые острые респираторные инфекции.
• Стоматит, молочница.

Важные замечания:

• Микробиота кишечника человека представляет собой сложную, динамичную систему, состоящую из множества групп микроорганизмов, которые взаимодействуют между собой и с организмом человека, выполняя ряд важных функций. Наиболее корректно оценивать микробиоту кишечника, рассматривая все группы микроорганизмов как компоненты одного целого.
• Тест предназначен для диагностики дисбиотических нарушений кишечника, связанных с хроническими воспалительными процессами, длительными нарушениями пищеварения, приемом антибиотиков и т.д. При наличии у пациента симптомов острой кишечной инфекции (рвота, диарея, боли в животе) в случаях, если ее возбудители обнаружены не были, исследование можно назначить.
• Алгоритм для формирования заключения разработан для лиц старше 14 лет. При исследовании образцов биоматериала пациентов младшего возраста итоговая оценка состояния микробиоты кишечника может быть затруднена.
• В основе микробиологического анализа кала на дисбактериоз и исследования методом ПЦР лежат две разных технологии, поэтому результаты могут различаться.