Генетическая устойчивость к ВИЧ (носительство мутации del32 в гене CCR5)

Код: 18c00865
Биоматериал
Кровь цельная с ЭДТА
Срок выполнения
до 10-ти дней
Метод
Автоматическое секвенирование ДНК

ВИЧ (вирус иммунодефицита человека) - инфекция, поражающая иммунную систему организма, последняя стадия которой известна как СПИД.

Среди генетических факторов, влияющих на восприимчивость к ВИЧ, наиболее широко исследовалась мутация del32 в гене CCR5, связанная с естественной устойчивостью к инфекции. Белок CCR5 – один из двух возможных корецепторов, используемых ВИЧ-1 для проникновения в CD4+ Т-клетки. Мутация del32 в гене CCR5 представляет собой делецию 32 п.н., приводящую к синтезу укороченного белка. Такой белок не может экспрессироваться на поверхности клетки и функционировать как корецептор для ВИЧ-1, тем самым препятствуя проникновению вируса в клетку. 

Подготовка к исследованию:

  • Специальной подготовки не требуется.

Референсные значения: обнаружено / не обнаружено

Повышение значений (положительный результат):

  • Данный анализ включает в себя множество показателей, оценку отклонений производит лечащий врач.

Уже несколько десятков лет лет мир знаком с вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ), который без должного лечения приводит к развитию синдрома приобретенного иммунодефицита (СПИД). Инфицирование вызывается ретровирусами ВИЧ-1 или ВИЧ-2. До настоящего времени вакцины против ВИЧ не разработано, не существует и методов лечения, позволяющих полностью избавиться от вируса. Противовирусная терапия достигла невероятного успеха в контроле репликации ВИЧ, однако существует потребность в новых подходах, способных предотвратить и полностью искоренить инфекцию. Известно, что некоторые люди резистентны к вирусу: признаки болезни у них либо сильно отсрочены, либо не появляются вовсе. Оказалось, что существуют генетические полиморфизмы, которые даже при заражении ВИЧ позволяют носителю вируса контролировать заболевание и хорошо себя чувствовать без приема лекарств. Основываясь на результатах исследований, проведенных к настоящему времени в разных странах, можно заключить: естественная устойчивость к ВИЧ-1 - чрезвычайно сложный многофакторный феномен, зависящий от генетики конкретного человека.

Впервые ВИЧ независимо друг от друга открыли в 1983 году два научных коллектива: в Институте Пастера во Франции под руководством Люка Монтанье (Luc Montagnier) и в Национальном институте рака в США под руководством Роберта Галло (Robert Gallo).

Мутацию del32 в гене CCR5, обеспечивающую невосприимчивость к ВИЧ, впервые обнаружили более 20 лет назад. Изучив геном нескольких тысяч современных людей из разных популяций, ученые выяснили, что мутация del32 в гене CCR5 возникла около 2500 лет назад в Северо-Восточной Европе. Считается, что данный аллель сформировался в результате одного мутационного события и в дальнейшем быстро распространился в Европе вследствие неизвестного селективного преимущества. Некоторые ученые предполагают, что эпидемии чумы и вирусной геморрагической лихорадки с 1347 по 1670 гг. привели к увеличению частоты мутации del32 в гене CCR5 до современных значений. Однако эти предположения остаются спорными. На сегодняшний день однозначно не установлено, что послужило причиной распространения этой мутации.

В 2007 году впервые предпринята попытка трансплантации гемопоэтических стволовых клеток гомозиготных по мутации del32 в гене CCR5 ВИЧ-1-инфицированному пациенту.

26 ноября 2018 года китайский биолог Хэ Цзянькуй (He Jiankuí) заявил, что с помощью системы CRISPR модифицировал ген CCR5 двух человеческих эмбрионов в ходе экстракорпорального оплодотворения, пытаясь сделать их устойчивыми к ВИЧ. В результате этого эксперимента родились девочки-близнецы, один ребенок нес гомозиготную мутацию del32 в гене CCR5, второй был гетерозиготен по данной мутации.

Инфицирование вирусом иммунодефицита человека вызывается одним из двух похожих ретровирусов (ВИЧ-1 и ВИЧ-2), которые разрушают CD4+ лимфоциты и ослабляют клеточный иммунитет, увеличивая риск оппортунистических инфекций и раковых образований. Ретровирус ВИЧ-1 – причина большинства ВИЧ-инфекций во всем мире, а ВИЧ-2 более характерен для отдельных районов Западной Африки. В некоторых областях Западной Африки распространены оба вируса, которые могут инфицировать пациентов одновременно. ВИЧ-2, по-видимому, менее вирулентный, чем ВИЧ-1.

Частота защитной мутации del32 в гене CCR5 варьирует среди разных популяций. У коренных африканцев, американских индейцев и этнических групп Восточной Азии эта мутация практически отсутствует, однако она распространена в Евразии и странах Северной Африки с частотой до 14%. Чаще всего аллель встречается в странах Северной Европы и на северо-западе России (до 16%), в южных странах несколько меньше (до 6% в Италии и около 4% в Греции). Евреи ашкенази также имеют высокие частоты аллеля del32 в гене CCR5.

Белок CCR5 – один из двух возможных корецепторов, используемых ВИЧ-1 для проникновения в CD4+ Т-клетки. Мутация del32 в гене CCR5 представляет собой делецию 32 п.н., приводящую к синтезу укороченного белка. Такой белок не может экспрессироваться на поверхности клетки и функционировать как корецептор для ВИЧ-1, тем самым препятствуя проникновению вируса в клетку. Однако эта мутация объясняет лишь 3,6% случаев естественной резистентности к ВИЧ.

Различные полиморфизмы в области гена CCR5 связаны со скоростью развития СПИДа и естественной устойчивостью к ВИЧ-инфекции. Мутация CCR5 G316A влияет на экспрессию корецептора, предполагая его связь с естественной устойчивостью к ВИЧ. Полиморфизм -2459 (A/G) в промоторе CCR5 связан с отсроченным прогрессированием СПИДа, а серопозитивные люди с генотипом G/G демонстрируют более медленное прогрессирование до СПИДа, чем люди с генотипом A/A. ВИЧ-1 может использовать альтернативные корецепторы для входа в клетку, мутации в которых также связывают с устойчивостью к инфекции и задержкой прогрессирования СПИДа. Генетический вариант в кодирующей области CCR2 V64I снижает экспрессию молекул CCR5 и CXCR4 на поверхности клетки, уменьшая доступность клеток для ВИЧ-1. Молекулы CCL3 (или MIP-1α), CCL4 (MIP-1β), CCL5 (RANTES) связываются с рецептором CCR5, конкурируя с вирусом. Мутации, приводящие к повышенной экспрессии этих молекул, могут подавлять ВИЧ-1-инфекцию. Полиморфизмы C459T CCL3, -28G и -403G/A CCL5 приводят к повышенной экспрессии этих белков и к ВИЧ-устойчивости. Такой же эффект показан и для рецептора CXCR4, с которым связывается фактор CXCL12. Мутация G801A в гене CXCL12 приводит к задержке прогрессирования СПИДа.

Иммунная система человека обнаруживает чужеродные клетки с помощью белков клеточной поверхности – антигенов лейкоцитов человека (HLA). Ниже приведены наиболее значимые мутации, связанные с уровнем вирусной нагрузки и контролем ВИЧ-инфекции, обнаруженные в комплексе HLA. Мутации HLA-B27, HLA-B57, HLA-B14, HLA-B44 и HLA-B51 имеют сильную ассоциацию с замедленной прогрессией ВИЧ-инфекции в СПИД. Аллели HLA-DRB101, HLA-DQB103:02 ассоциированы с устойчивостью к ВИЧ-инфекции.

Есть еще несколько групп генов, мутации в которых ответственны за устойчивость к ВИЧ-инфекции и/или развитию СПИДа (TLR, TIM3, MX2, APOBEC3, дефензины, CD209, гены, кодирующие белки семейства TRIM, сигнальный путь витамина Д и интерферона III типа).

Появляется все больше данных о ведущей роли эпигенетических факторов в развитии вирусных инфекций. Показано, что ВИЧ напрямую взаимодействует с рядом эпигенетических факторов клетки хозяина и мутации в соответствующих генах могут влиять на резистентность к вирусу.

Статус устойчивости к ВИЧ не является постоянным и может измениться со временем.